京都薬科大学は2025年12月22日、現職の赤路健一学長の任期満了（2026年3月31日）に伴い、次期学長に和歌山県立医科大学薬学部教授の平田收正（ひらた・かずまさ）氏を選出したと発表した。 12月19日の理事会において決定したもので、任期は2026年4月1日から2030年3月31日までの4年間となる。

高知県と京都薬科大学は、地域医療の未来を確かなものとするため、相互の人的・知的資源の交流及び活用を図る連携協定を2025年9月24日に締結した。

京都薬科大学は、2025年10月26日（日）に薬用植物園開設100周年を記念した公開講座を開催する。本講座は一般向けに無料で実施され、事前申込制となっている。

京都薬科大学は2026年2月完成予定の新校舎の名称を公募しています。